粤港澳物流合作园将培育成具有创新亮点的生态低碳型的第三代物流园区、国内外有影响力的物流营商新园区。建设集港口、自贸区、综保区、渔港等一体化的区港联动物流发展区、成为珠港澳三地物流合作示范区、承接国家“三互”查验机制的创新试点、进出港澳物流和国际市场的物流枢纽、大西南地区的出海平台、川贵广-港澳-南亚国际物流大通道的门户和21世纪海上丝绸之路的重要节点。
粤港澳物流合作园规划总占地面积为90万平方米（1350亩），总体投资预算34.875亿元人民币，建设工期为3.5年时间，粤港澳物流合作园总体功能布局规划为“一园、十区、两平台”。
一园：即粤港澳物流合作园。
十区：设立综合陆路口岸联检区、国际甩挂服务区、跨境电商服务区、智慧农副食品加工配送区、华南物流装备展示交易区、物联网应用示范区、金融物流服务区、区港联动综合配套区、港澳物流合作区、贵物流分拨区等十个功能区。
两平台：海关联检保税公共信息平台、国际物流采购展示交易公共信息平台两个平台。
